User talk:Michael Hapala

Zadání semestrálního projektu:

Modelování přenosu nákazy klíšťovou encefalitidou

Simulační prostředí: Netlogo

Popis modelu: V modelu by byly zastoupeny 3 druhy agentů. Klíšťata jako přenašeči, hlodavci jako rezervoáry pro přenos encefalitidy a lidé. Prostředí, ve kterém se agenti pohybují by mělo představovat oblast s citelným výskytem hlodavců a vysokým podílem klíšťat s virem encefalitidy. Prostředí by tedy pro agenty hlodavec a klíště představovalo oblast ve které se neustále pohybují a rozmnožují, zatímco lidé by do oblasti přicházeli a odcházeli (bylo by vyřešeno tak, že přichází na jedné straně a náhodně se pohybují s úhlem omezeným na 180° a tím pádem odchází na druhé straně). Model by měl zohlednit reálná fakta:

- virus se obvykle vyskytuje u 3-4% hlodavců
- hlodavec se dožívá 3-7 let
- pohlavní zralost u obou pohlaví hlodavce nastává po 50 dnech
- v jednom vrhu samice je 3-6 mláďat
- virus je se přenáší na 90% mláďat rodičů nakažených virem

- klíště se dožívá v průměru dvou let (ale věk dožití se může výrazně lišit)
- dospělost klíštěte nastává nejdříve po jednom roce života
- samice klade 1000 až 3000 vajíček, přičemž dospělosti se dožije 1-3% klíšťat
- stadium larvy a nymfy by nebylo modelováno, nová klíšťata by ovšem měla příslušně posunuta možnost páření
- krátce po nakladení samice umírá
- získát vir encefalitidy může sáním od hlodavce nebo jej může přenést samec při páření na samici a celé její následné potomstvo
- k paření dochází na hostiteli (hlodavci), k nakladení vajíček na zemi
- pokud klíště nemá určitou dobu potravu, tj. včas se nepřisaje, zemře

- pravděpodobnost přenosu viru na člověka z infikovaného klíštěte je 30 až 40%
- riziko nákazy u očkovaných lidí by se snížilo o 97% oproti neočkovaným

Model by zohlednil reálné faktory obrany člověka proti klíštěti ( vhodné oblečení nebo repelent ) pravděpodobností přisátí při setkání s člověkem. Člověk si v modelu přisáté klíště odnese sebou (klíště pak umírá). Člověk nakažený encefalitidou by byl barevně odlišen, s určitou malou pravděpodobností by zemřel. Počítalo by se promile nakažených a zemřelých na počet lidí, kteří oblast navštívili.

Výstup simulace: vývoj podílu nákazy encefalitidou a úmrtí u lidí v závislosti na proočkovanosti, hustotě hlodavců a klíšťat v oblasti